1. Вы сами ответили на этот вопрос: порт может оставаться разбитым до конца игры, пока его не займёт один из игроков.

2."Берег" - это там, где заканчивается разлиновка "в клетку".

3.На карте или в самих карточках колоний? У меня в игре и там и там в красных квадратиках.Лучше было бы взглянуть на скрин-шот.

Вообще, на своей странице ВК я собираюсь более детально и в картинках описать правила игры. Можете следить за публикациями.