По сюжету игры, после приступа в Международном аэропорте имени Джона Кеннеди нулевого пациента отвезли в местную больницу. Как оказалось, он привёз из Конго постоянно мутирующий вирус, с которым не могут справиться никакие известные противовирусные препараты. В результате игрок выступает в роли главы отдела по контролю за распространением инфекции при развёрнутом в Нью-Йорке временном штабе. В его задачи входит принимать решения о том, какие части вируса изучать, какой персонал нанимать и какое оборудование приобретать. Во время игры главу отдела ждёт неприятное открытие: не все учёные-исследователи могут ладить друг с другом. А это мешает совместной работе и общему делу. Как следствие, растёт стресс и количество ошибок, но нужно успеть найти вакцину до того, как будет слишком поздно, для всего человечества.