Выступая в роли Росомахи, Циклопа, Магнето и Грозы, игроки возглавляют четыре школы для обладателей генома «Фактор Икс», у каждой из которых своё видение места мутантов в мире, уникальные игровые особенности и возможности. Набирая героев и учеников, обучая команды и посылая их на задания, распространяют своё мировоззрение. В основу игры ляжет игровой движок от Spartacus: A Game of Blood & Treachery, адаптированный под новый сеттинг.