В ALIEN: Fate of the Nostromo игроки берут на себя роль членов экипажа Nostromo Рипли, Ламберта, Паркера, Бретта или Далласа. В течение игры они собирают металлолом, изготавливают предметы и выполняют различные задачи. Экипаж будет терять и набирать боевой дух, сталкиваясь с Чужим и другими ситуациями. Если боевой дух экипажа достигает нуля, игроки проигрывают игру.

Каждый ход состоит из двух фаз. На этапе действия команды игроки ползают по залам Ностромо, собирая металлолом, создавая предметы, обмениваясь металлоломом и предметами с другими игроками, а также используя предметы и их особые способности. Бретт, например, может создавать предметы с одним меньшим количеством лома, чем другие игроки. Если Чужой находится в пределах трех пространств от игрока с мусоросжигателем, этот игрок может использовать мусоросжигатель, чтобы отправить инопланетянина обратно в его гнездо.

На этапе Встречи игроки разыгрывают и разрешают карту Встречи. Инопланетянин мог скрываться за любым углом...

Как только игроки выполнят свои первоначальные задачи, им предстоит выполнить одну из пяти финальных миссий, каждая из которых имеет уникальный набор требований. Игроки должны одновременно выполнить требования финальной миссии, чтобы выиграть игру. Игроки также могут представить научного сотрудника Эша для более сложной игры. Он движется по кораблю, удаляя металлолом и заставляя экипаж терять боевой дух